O CGPP-IBMC integra o consórcio da GenomePT, laboratório nacional para sequenciação e análise genómica (POCI-01-0145-FEDER-022184), tendo como Investigadores Principais o Prof. Jorge Sequeiros e o Doutor Jorge Oliveira. Este consórcio integra também o Roteiro Nacional de Infraestruturas de Investigação da Fundação de Ciência e Tecnologia (FCT).
A GenomePT tem como missão a disponibilização de serviços de sequenciação e bioinformática para projetos de âmbito genómico coordenado por parceiros nacionais e internacionais de natureza multidisciplinar, incluindo (entre outras) as áreas da saúde e da biotecnologia.
Congrega atualmente mais de 50 investigadores e técnicos de diversas instituições, ou seja, constituindo uma das principais massas críticas na área da genómica e bioinformática no panorama nacional.
O equipamento permite a extração de DNA genómico automatizada, a partir de uma variedade de diferentes tecidos, incluindo sangue periférico, buffy coat, tecidos fixados com formol e impregnados em parafina (FFPE), bem como de culturas celulares.
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Espectrofotómetro que permite quantificar e avaliar a qualidade de amostras de DNA, RNA e proteína.
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Sistema de eletroforese capilar, desenhado para executar de forma rápida e completamente automatizada a análise de fragmentos de DNA e a analise quantitativa e qualitativa de RNA.
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Sistema de eletroforese multicapilar de alta resolução com um sistema de deteção lazer acoplado. A eletroforese capilar é o gold-standard para a análise de fragmentos e sequenciação de Sanger.
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Ffluorómetro de bancada utilizado para a quantificação de amostras de DNA, RNA, microRNA, e proteína, permite também determinar a integridade e qualidade do RNA.
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Este sistema é utilizado para uma variedade de processos, relacionados com a quantificação e determinação de tamanhos (nas gamas de 35 pb a 60 Kpb e 5 pg/µL a 100 ng/µL), tornando-se essencial para a quantificação de bibliotecas genómicas de NGS e também para verificar a integridade de amostras de RNA.
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Sistema de sequenciação maciça em paralelo (NGS). As amostras são colocadas num chip que permite a deteção de flutuações ligeiras no PH. Estas alterações de PH são decorrentes da libertação de H+ aquando da incorporação de nucleótidos complementares à sequenciação de DNA em análise. Esta flutuação é detetada e diretamente convertida num sinal de voltagem por um sensor semi-conductor (do tipo CMOS). Devido a estas características trata-se de um sistema rápido e de baixa manutenção.
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